Instrukcja instalowania bumblebee na debianie:
https://wiki.debian.org/Bumblebee
Problem może jednak leżeć w specyfice karty nvidii (w zasadzie zarządzaniem energią - uruchamianiem karty niezintegrowanej). Np nie udało mi się do tej pory (i być może nikomu) zmusić do pracy w trybie hybrydowym karty GT820M w linuksie (komputer asus eb1037). Usiłowanie zmuszenia karty do pracy wiązało się z zawieszaniem komputera w trakcie startu (obojętnie, czy sterowniki nouveau, czy nvidii, nieważne która wersja - ostatnia próba przed rokiem). Być może to tego typu problem ...
Może nowe wydanie debian stretch rozwiąże ten problem. Można też spróbować, jak sugeruje @Robert75, z manjaro. Napisz o efektach.
Alternatywnym rozwiązaniem jest wykorzystanie rozwiązania nvidia-prime, które niestety jest wykorzystywane obecnie chyba tylko w ubuntu i mincie. Jest to odmienny sposób zarządzania grafiką hybrydową od bumblebee (niestety, u mnie z kartą GT820M nie pomogło)