Na moim kompie też bywa różnie. Teoretycznie w systemach z rodziny Ubuntu nie powinno być różnic w sterownikach. Różnice w działaniu środowisk mogą wynikać z innego wykorzystywania tych samych sterowników przez poszczególne komponenty (programy) danego środowiska. Jeżeli na Twoim komputerze Unity/GNOME 3 działa najlepiej, to znaczy, że najlepiej wykorzystuje możliwości Twojego sprzętu, karty graficznej, procesora itp. Trzymaj się tego, co u Ciebie działa najlepiej i po problemie.